A Kutatási és Technológiai Innovációs Alapról szóló 2003. évi XC. törvény szerint nem kell innovációs járulékot fizetni a mikro és kisvállalkozásoknak. A mikro,- kis,- és középvállalkozásokról szóló törvény (a továbbiakban: KKV. Törvény) 5. §-a szerint, amennyiben egy vállalkozás partner vagy kapcsolt vállalkozásnak minősül, akkor a létszám, illetve az árbevétel vagy a mérleg-főösszeg adatait össze kell adni. Miután az innovációs járulékról szóló jogszabály a KKV. törvény 3. §-ára hivatkozik csak vissza, így a társaságokat csak önállóan a saját adataik alapján kell figyelembe venni az innovációs járuléknál. Ha tehát a társaságnál az elmúlt években az éves létszámadat 50 fő alatt maradt, akkor kisvállalkozásnak minősül, így innovációs járulékot nem kell fizetnie. 2008. májusi állapot szerint.